Pertenece al partido de La Plata , en la Provincia de Buenos Aires , bajo control directo de la Dirección de Islas del Ministerio de Gobierno , encargado de la conducción administrativa de la isla, y del Ministerio de Asuntos Agrarios , a cargo de la preservación de la flora y la fauna. Constituye una reserva natural de uso múltiple.
A pocos cientos de metros al norte de la isla se encontraba el islote Timoteo Domínguez , anteriormente llamado Punta Bauzá por la Argentina, que disputó su posesión, el cual debido a la sedimentación aluvional se unió a la isla Martín García.
Desde el acuerdo del 18 de junio de 1988 entre ambos gobiernos, se ha establecido una frontera seca en la ahora isla Martín García - Timoteo Domínguez . Frente a la isla se encuentra la pequeña localidad oriental de Martín Chico, de la cual dista unos 8 km.
La Isla Martín García es un exclave de la Argentina situado en aguas uruguayas del Río de la Plata .