Aunque inicialmente su campo de influencia abarcaba no sólo a la provincia de Santa Fe sino también a toda la región conocida como el Litoral, luego de la creación de la Universidad Nacional del Nordeste en 1956, la Universidad Nacional de Rosario en 1968, y de las universidades nacionales de Entre Ríos y Misiones en 1973 como consecuencia del plan Taquini, vio considerablemente reducida su matrícula e instalaciones propias, muchas de las cuales se desmembraron para formar las nuevas casas de estudios.
En la actualidad la Universidad Nacional del Litoral cuenta con nueve Facultades: de Ciencias Jurídicas y Sociales, de Ingeniería Química, de Ciencias Económicas, de Ciencias Agrarias, de Ciencias Veterinarias, de Arquitectura y Urbanismo, de Ingeniería y Ciencias Hídricas, de Bioquímica y Ciencias Biológicas y de Humanidades y Ciencias en las que se dictan 11 carreras de pregrado, 58 de grado y 60 posgrados. Tiene una cantidad total de estudiantes que ronda los 30.000 a 2006.